واکسیناسیون یکی از مؤثرترین و کم‌هزینه‌ترین مداخلات بهداشت عمومی برای پیشگیری از بیماری‌های عفونی است و نقش اساسی در کاهش مرگ‌ومیر، افزایش ایمنی جمعی و کنترل اپیدمی‌ها دارد. برنامه ملی واکسیناسیون، با هدف ایجاد ایمنی پایدار در جمعیت، بر پایه تزریق منظم و استاندارد واکسن‌های ضروری در گروه‌های سنی مختلف طراحی می‌شود و باعث می‌گردد بیماری‌هایی که زمانی شایع و مرگبار بودند، مانند سرخک، دیفتری و فلج اطفال، به طور چشمگیری کاهش یافته یا ریشه‌کن شوند. با اضافه شدن واکسن‌های پنوموکوک، روتاویروس و هموفیلوس آنفلونزا به جدول ملی واکسیناسیون، به طور خلاصه توضیحی درباره این سه واکسن در ذیل آورده شده است.

واکسن روتاویروس: روتاویروس یک ویروس بسیار مسری است که با اثر روی دستگاه گوارش نوزادان و کودکان منجر به اسهال شدید، استفراغ و کم آبی بدن می‌شود که در صورت شدت بیماری، کودک را در معرض خطر بستری شدن در بیمارستان یا مرگ قرار می‌دهد. واکسن روتاویروس برای پیشگیری از عفونت روتاویروس در کودکان استفاده می‌شود. این واکسن به صورت خوراکی مصرف می‌شود و به صورت قطره‌ در دهان کودک و در سه بازه 2، 4 و 6 ماهگی ریخته می‌شود.

واکسن پنوموکوک: این واکسن برای پیشگیری از بیماری‌های تهاجمی ناشی از باکتری استرپتوکوک پنومونیه مانند عفونت ریه و مننژیت در نوزادان و کودکان تایید شده و همچنین به طور قابل توجهی میزان بروز اوتیت میانی (عفونت گوش میانی) حاد را کاهش می‌دهد. این واکسن انواع مختلفی دارد که برای نوزادان در سیستم واکسیناسیون ایران نوع Pneumococcal Vaccine 10-Valent در 2، 4 و 12 ماهگی تزریق می‌شود.

واکسن پنجگانه (پنتاوالان) بر علیه دیفتری ، سیاه سرفه، کزاز ، هپاتیت ب و هموفیلوس آنفلوانزا نوع ب است. دیفتری ، سیاه سرفه کزاز (واکسن سه گانه) و هپاتیت قبلاً جزو  برنامه ملی واکسیناسیون کودکان بوده و جداگانه تزریق می‌شده ولی این 4 واکسن به همراه هموفیلوس آنفلوانزا نوع ب (HIB) 5 واکسنی است که در کنار هم واکسن پنتاوالان را می‌سازند و در 2، 4 و 6 ماهگی تزریق می‌شود. هموفیلوس آنفلوانزا تیپ B یک باکتری است و با واکسن آنفلونزا که مربوط به ویروس آنفلونزا است فرق دارد. هموفیلوس آنفلوانزا تیپ B  باعث ایجاد عفونت‌های شدید مننژیت باکتریایی، عفونت ریه و خون، التهاب گلو و انسداد مجاری هوایی ودر نهایت بستری شدن کودکان در بیمارستان و یا مرگ می‌شود.